上海市普陀区人民政府办公室、上海市普陀区人民政府机关事务管理局设15个内设机构,即:
(一)秘书科(联络科)
(二)组织人事科
(三)督查科
(四)综合科
(五)调研科
(六)数据发展管理科
(七)政务公开科
(八)法律事务科
(九)外事科
(十)对口支援科
(十一)区域合作科
(十二)行政审批制度改革科
(十三)财务管理科
(十四)行政管理科
(十五)办公用房管理科